การสลับกันของระบบอัตโนมัติและระบบต่อมไร้ท่อเพื่อตอบสนองต่อการกระตุ้นอวัยวะภายใน ในผู้ป่วย IBS การเพิ่มความไวของลำไส้ใหญ่ต่อปัจจัยต่างๆ เช่น การติดเชื้อ การอักเสบเรื้อรัง จุลินทรีย์ในทางเดินอาหาร (GI) และการควบคุมที่บกพร่อง ลำไส้แปรปรวน ดูเหมือนจะมีความสำคัญในการเกิดโรคของ IBS การเพิ่มความไวของลำไส้ใหญ่ในการตอบสนองต่อความเครียด อาหาร การกระตุ้นทางกายภาพ CCK และปัจจัยการปลดปล่อยคอร์ติโคโทรปิน (CRF) แสดงให้เห็นอย่างชัดเจนในบุคคลที่บ่นว่าเป็นโรค IBS การ เปลี่ยนแปลงยังแสดงให้เห็นในการเคลื่อนไหวของลำไส้ ในรูปแบบของการเพิ่มขึ้นของ MMC และการหดตัวของลำไส้เล็กส่วนต้นและลำไส้เล็กส่วนต้นถอยหลังเข้าคลอง 22 - 24การหดตัวของแอมพลิจูดสูงจำนวนมาก (HAPCS) ดูเหมือนจะแนะนำการเพิ่มขึ้นของ IBS-D และการลดลงของ IBS-C